摘要：根据GenBank公布的猪瘟病毒（CSFV）标准参考毒株全基因组序列，设计11对引物，应用RT-PCR方法分别对11个片段进行福建流行毒株CN-FJLY的全基因组扩增，与参考毒株进行序列分析比较。结果表明，福建流行毒株CN-FJLY基因组全长为12296hp，与参考毒株SXCDK、HEBZ、GXWZ02、HN-LY-2011和Zj080l的全基因组核苷酸同源性为93．0％-97．0％，而与1．1亚群的中国强毒Shimen、疫苗株HCLV全基因组核苷酸同源性为84．4％-85．39／6。基于全基因组及E2基因构建的遗传进化树分析结果表明福建流行毒株CN-FJLY属于2．1b亚群，与Shimen株、HCLV疫苗株亲缘关系较远。与HCLV相比较CN-FJLY基因组变异较大的是5’UTR、E^ms、E2、p7、NS2、NS5A、NSSB和3＇UTR。综上说明福建省猪瘟病毒流行毒株正在向远离疫苗株的方向变异。
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关键词：猪瘟病毒 全基因组 序列分析 遗传变异
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