摘要：目的：研究抗感染药物作用新靶点CrtN的结构及其与抑制剂萘替芬的作用机制,为新型CrtN抑制剂的发现奠定基础。方法：采用同源模建获得CrtN的三维结构,然后用分子动力学方法优化初始结构,并用Ramachandran图评估结果,最后通过活性位点搜索、分子对接和动力学模拟研究抑制剂萘替芬与CrtN的作用模式。结果：通过同源模建和动力学优化获得合理的CrtN结构用于药物与靶点的相互作用研究。对CrtN进行活性位点搜索,确定Site 4口袋作为萘替芬的结合位点。通过分子对接及动力学模拟发现萘替芬与M51、P53、I55、I85、P146、Y150、Y190、L311、L376等形成疏水作用,与Y354形成阳离子-π键作用。结论：首次对CrtN的三维结构进行研究,阐明了疏水和阳离子-π键作用是萘替芬对CrtN产生抑制活性的重要分子基础。
分类：期刊> 自然科学与工程技术> 医药卫生科技> 医药卫生综合
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关键词：crtn 萘替芬 同源模建 分子动力学 分子对接
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