摘要:预测和分析结核分枝杆菌Rv2181抗原的T细胞表位和B淋巴抗原表位的分布状况。首先从NCBI中得到蛋白的氨基酸序列,接着通过BLAST将人类蛋白和得到的序列进行同源性分析,使用SYFPEITHI对MTB中Rv2181蛋白的T淋巴细胞抗原表位,取得分在前2%的多肽作为优势抗原,然后用NETCTL、Net MHC和BIMAS等数据库预测抗原CD8^+T和CD4^+T细胞表位,综合结果筛选出优势肽段。利用Protean预测到的B细胞抗原表位,再根据IEDB、ABCpred、Bcepred等数据库预测,排除α-螺旋、β-折叠内不易形成表位的序列,将位于β-转角、无规则卷曲处的表位确定为优势表位。通过预测、分析,筛选出Rv2181抗原CD4^+T细胞表位中强结合表位120个,弱结合表位495个,综合CD4、8^+T的预测,最终筛选出1个优势表位肽段,确定7条优势的B细胞抗原表位区域。预测T、B细胞候选表位为结核病诊断和治疗有重要价值。
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关键词:结核分枝杆菌 rv2181 t细胞 b细胞 表位分析
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