摘要：目的：应用生物信息学的方法研究伴放线放线杆菌（Aa）细胞致死性扩张毒素（CDT）的3个蛋白亚基在不同细菌中的序列变化情况,为牙周病中Aa菌株的检测提供思路。方法：运用ncbi genbank数据库、蛋白同源性比对（blast P和tblastn）及极大似然法构建进化树等,研究Aa中CDT蛋白的3个亚基在不同菌种的序列保守性。结果：在Genbank数据库674个属的细菌中,发现有20个属27个种含有CDT蛋白亚基,其中11个种的细菌只含有Cdt B蛋白亚基。在进化过程中,Cdt B与CDT其他两种亚基蛋白相比,序列间的变化无明显相关性,且蛋白序列更为保守。系统进化树分析表明,Aa的Cdt B蛋白与嗜血杆菌属、沙门氏菌属和螺杆菌属的细菌有较近的亲缘关系。结论：Aa CDT蛋白复合体的Cdt B与其他两个亚基的蛋白在序列进化上存在显著差异,推测一些菌种中CDT蛋白毒性功能的发挥并不需要3个亚基共同存在。
分类：期刊> 自然科学与工程技术> 医药卫生科技> 口腔科学
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关键词：伴放线放线杆菌 细胞致死性扩张毒素 进化 生物信息学
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