摘要：目的分析2017年两株肠道病毒71型（enterovirus 71,EV71）分离株的全基因组及其遗传特性。方法收集手足口病（hand,foot and mouth disease,HFMD）粪便样品,采用RD细胞进行病毒分离;提取病毒RNA,采用RTPCR法分段扩增EV71全长基因组,经测序和拼接后,利用Mega 6.06和SimPlot 3.5.1等软件进行分析。结果两株EV71分离株4-23/XY/CHN/2017和6-4/XY/CHN/2017基因组全长均为7 406 bp,编码含2 193个氨基酸残基的多聚蛋白。通过Mega 6.06软件分析显示,与EV71/SZ50/CHN/2014株全基因的核苷酸同源性最高（97.6%）,其VP1核苷酸同源性与EV71/FJFZ422/CHN/2015株最高（99%）。在全基因组上,与原型株Br Cr的核苷酸同源性分别80.6%和80.7%,氨基酸同源性均为99.3%;在VP1序列上,与C4a基因型其他毒株的核苷酸和氨基酸同源性分别94.5%-99.3%和97.3%-98.5%。进化分析显示,这两分离株属于C4a基因型。重组分析未发现重组事件发生。结论 2017年襄阳分离株4-23/XY/CHN/2017和6-4/XY/CHN/2017属于C4a基因型,且未发生重组。
分类：期刊> 自然科学与工程技术> 医药卫生科技> 基础医学
收录：CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版) > 统计源期刊(中国科技论文优秀期刊) > 知网收录(中) > 维普收录(中) > 万方收录(中) > CA 化学文摘(美) > JST 日本科学技术振兴机构数据库(日) > Pж(AJ) 文摘杂志(俄) > 哥白尼索引(波兰) > 国家图书馆馆藏 > 上海图书馆馆藏 > 文摘杂志 > 医学文摘
关键词：手足口病 肠道病毒71型 全基因组 序列分析
注：因版权方要求，不能公开全文，如需全文，请咨询杂志社
