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首页 期刊 中国畜牧兽医 伏牛白山羊TACR 1基因扩增及生物信息学分析(非官网)

伏牛白山羊TACR 1基因扩增及生物信息学分析

摘要:本研究旨在克隆伏牛白山羊TACR 1基因,并对其结构和编码蛋白进行生物信息学分析,为进一步研究TACR 1基因的功能及其在生殖生理和免疫调节中的作用奠定基础。根据GenBank中已发表的山羊TACR 1基因(登录号:NC_030818.1)序列设计引物,对伏牛白山羊TACR 1基因进行分段PCR扩增并测序,拼接后得到包含TACR 1基因完整编码区的序列片段。结果表明,伏牛白山羊TACR 1基因开放阅读框(ORF)全长852 bp,共编码283个氨基酸,碱基组成为:A(23.47%)、T(25.49%)、C(27.76%)和G(23.27%)。与绵羊相比,伏牛白山羊TACR 1基因编码区发生了2个碱基突变,但没有引起氨基酸的改变。5′端非编码序列长为860 bp,发生了9个碱基突变;3′端非编码序列长为271 bp,发生了2个碱基突变。同源性分析结果显示,伏牛白山羊与卡普拉山羊、藏羚羊、绵羊、瘤牛、白尾鹿、白鳍豚、人、野猪、金钱豹、土拨鼠、野驴TACR 1基因同源性分别为99.9%、99.3%、99.2%、97.5%、96.7%、92.9%、89.7%、88.6%、86.3%、86.2%和85.0%。SignalP 4.1在线软件预测结果显示,TACR1 N末端存在信号肽且可能在21位氨基酸处存在裂解位点;蛋白质结构预测发现伏牛白山羊TACR 1基因编码蛋白没有跨膜结构域。

分类:期刊> 自然科学与工程技术> 医药卫生科技> 感染性疾病及传染病

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关键词:伏牛白山羊 tacr 1基因 生物信息学分析 

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