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福建省漳州市2013-2015年流行麻疹病毒基因型别鉴定及基因特征分析

摘要:目的 了解2013-2015年漳州市麻疹病毒基因型流行情况。方法 用Real-time RT-PCR法对2013-2015年漳州市的392份疑似麻疹病例咽拭子标本进行核酸检测;用RT-PCR法扩增核酸阳性标本的N基因羧基末端594个核苷酸片段,并对扩增产物测序;以N基因羧基末端450个核苷酸序列构建系统进化树,并进行核苷酸和氨基酸同源性分析。结果 28份标本麻疹病毒核酸阳性,阳性率7.1%(28/392);获得21份麻疹病毒的核苷酸序列,经基因型鉴定18株为H1a基因亚型,1株为A基因型,2株为D8基因型。漳州市所有的H1a亚型麻疹病毒与H1a亚型参考株China93-2-AF045205.1-H1a之间核苷酸和氨基酸同源性分别为98.0%-99.1%和97.3%-99.3%。A基因型麻疹病毒与疫苗株Shanghai-191-DQ390225-A的核苷酸和氨基酸同源性分别为99.6%和99.3%。2株D8基因型麻疹病毒之间核苷酸和氨基酸同源性均为100%,它们与世界卫生组织(WHO)参考株MVi/Manchester.GBR/30.94-AF280803-D8的核苷酸和氨基酸同源性分别为96.4%和96.7%。结论 2013-2015年漳州市麻疹病毒优势基因型为H1a基因亚型;A基因型为疫苗相关株;漳州市首次出现D8基因型麻疹病毒输入性病例。

分类:期刊> 自然科学与工程技术> 医药卫生科技> 预防医学与卫生学

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关键词:麻疹病毒 核蛋白基因 基因型 

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