摘要：目的了解2001—2006年间辽宁省甲3亚型流感病毒HA1基因变异特征。方法采用辽宁省流感监测的咽拭分离株，对其中的7株甲3病毒核酸提取，经逆转录一聚合酶链反应（RT—PCR），扩增产物测序，推导出其氨基酸序列，并用DNAMAN软件包中的Alignment做了差异和同源性比较，用Mega软件包中的Neighbor Joining方法，通过与NCBI数据库中2000--2006年28株H3N2流感病毒同源比对后，制作种系进化树，进行基因进化特征分析。结果序列分析发现，甲3亚型流感病毒与WHO当年的疫苗株A／California／7／2004比较，在其HA1核酸序列上有12处碱基不同，4个氨基酸位点发生了替换。基因及氨基酸序列同源性下降。与WHO北半球疫苗株A／Wisconsin／67／2005序列更接近，但仍有4处碱基不同。结论甲3亚型流感病毒基因序列发生了变异，与甲3亚型疫苗株A／California／7／2004同源性有下降趋势，提示其抗原可能发生部分漂移或更换，与南方浙江2005年株、WHO北半球2006--2007疫苗株A／Wisconsin／67／2005序列接近，提示南方春夏季流感流行株极有可能在北方秋冬季流行，对流感流行病学监测，疫苗株使用指导都具有重要意义。
分类：期刊> 自然科学与工程技术> 医药卫生科技> 基础医学
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关键词：正粘病毒科 基因 ha1 序列分析
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