摘要:目的鉴定中国人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)DRB1*1218新等位基因,分析新等位基因第1和2内含子序列信息。方法采用聚合酶链反应一序列特异寡核苷酸探针反向杂交法(polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide probes,PCR—SSOP)对广东地区随机正常人群进行HLA常规基因分型,发现1个与HI。A-DRB1*120201相近的未知基因,对先证者DNA应用组特异性引物扩增HLA—DRB1位点第2外显子,PCR产物经克隆到质粒载体中以获得单链,对克隆所得产物进行HLA—DRB1基因的第2外显子及第1和第2内含子双向测序分析,并与DRBl*120201基因序列的第2外显子和DRBl*03010101等位基因内含子相比较。结果发现该个体的一个HLA—DRB1*080302基因被确认,而另一个HI。A—DRB1基因为新等位基因,其序列被GenBank接受(编号为FJ481086)。新等位基因与最相近的DRB1*120201相比,在第2外显子上有1个核苷酸的不同,即第262位G—C(密码子59GAG—CAG,氨基酸59G1u—GIn)。DRB1*1218与DRB1*03010101等位基因第2内含子序列完全相同,而与DRB1*03010101等位基因第1内含子序列相比较有12个碱基不同。结论发现并鉴定一个新的HLA等位基因,经世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA—DRB1*1218.
分类:期刊> 自然科学与工程技术> 医药卫生科技> 基础医学
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关键词:人类白细胞抗原 等位基因 外显子 内含子
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