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首页 期刊 中华医学遗传学 HLA-Cw基因全长序列分子克隆及测序方法的建立(非官网)

HLA-Cw基因全长序列分子克隆及测序方法的建立

摘要:目的建立可靠的HLA-Cw基因全长序列的分子克隆和测序技术。方法设计合成HLA-Cw基因全长序列PCR引物和探索PCR反应体系,采用长距离PCR技术,扩增HLA-Cw基因非翻译区(untranslatedregion,5′-UTR)区、8个外显子、7个内含子和3′-UTR区,全长约4.5kb。PCR产物纯化后进行分子克隆,筛选阳性克隆,提取质粒DNA,采用自行设计的测序引物进行全长双向测序。12份已经AlleleSEQRHI。A-Cw测序分型试剂盒进行PCR产物直接测序、基因型已知的样本,分别用TaKaRaLATaq酶和StratagenePfuTaqDNA聚合酶进行HI,A-Cw基因全长扩增,以及PCR产物分子克隆和序列测定,克隆测序结果分别与PCR产物直接测序结果进行对比分析。结果PCR扩增获得了特异性目的片段,测序获得了HLA-Cw基因-962~3576位碱基全长序列。克隆测序结果的对比表明,Pfu酶保真性高于LATaq酶。比较本文测定的Cw*010201与Cw*07020101等位基因序列,在5′上游-962~-284位碱基区域存在11个单核苷酸多态(single nucleotide polymorphisms,SNPs)和2个插入(或)缺失多态性位点;3′-UTR下游3067~3576位碱基区域存在11个SNPs和1个插入(或)缺失。结论建立了HLA—Cw基因全长序列分子克隆及测序方法,在HLA—Cw基因全长序列分子多态性及表达调控等研究领域,具有广泛应用前景。

分类:期刊> 自然科学与工程技术> 医药卫生科技> 基础医学

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关键词:人类白细胞抗原 全长序列 克隆 测序 

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