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首页 期刊 肿瘤预防与治疗 基于GEO数据库及生物信息学方法筛选食管癌放射抗拒关键基因及通路(非官网)

基于GEO数据库及生物信息学方法筛选食管癌放射抗拒关键基因及通路

摘要:目的:基于芯片数据采用生物信息学方法,寻找食管癌放射抗拒的关键分子及通路。方法:GEO数据库中下载食管癌放射抗拒mRNA表达谱芯片数据,使用Morpheus软件进行差异基因的统计学分析,利用生物信息学相关软件对这些基因进行生物学过程、信号通路及互做网络分析。结果:在GEO中获得GSE61686芯片数据,199个差异基因与食管癌放射抗拒相关,其中上调表达99个,下调表达100个。这些基因参与的生物学过程有代谢、刺激反应、细胞黏附、细胞再生及免疫过程。主要涉及23条信号通路。结论:利用生物信息学方法能有效分析基因芯片数据。食管癌放射抗拒的发生是多基因共同参与的结果,为寻找提高食管癌放射敏感性相关靶标提供新思路。

分类:期刊> 自然科学与工程技术> 医药卫生科技> 肿瘤学

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关键词:食管癌 放射抗拒 geo 生物信息学 

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