Nature Microbiology（中文译名：《自然微生物学》），ISSN：2058-5276，EISSN：2058-5276，是Springer Nature出版的国际性学术期刊，创刊于2016年，以12 issues per year形式稳定发行，2026年总发文量约239篇。该刊采用非OA开放访问，学科归属为Immunology and Microbiology - Microbiology。该刊是生物、微生物学领域的国际权威刊物，已被SCI（科学引文索引）、SCIE（科学引文索引扩展版）等国际主流学术数据库收录。2026年期刊影响因子达18.7，2025年期刊CiteScore为28.8，2025年期刊自引率约1.6%，在中科院期刊分区体系中位列生物学大类1区TOP 期刊，在所属学科领域具备高学术影响力与国际认可度。Nature Microbiology长期聚焦生物、微生物学及相关产业的技术应用前沿，在稿件录用评判中，该刊将创新性与前沿性作为核心遴选标准，重点收录能够对生物、微生物学领域的落地与发展产生实质性推动价值的研究成果。
从全球发文格局来看，USAEngland、GERMANY (FED REP GER)、CHINA MAINLAND、France、Australia、Canada等为核心发文国家与地区；UNIVERSITY OF CALIFORNIA SYSTEMHARVARD UNIVERSITY、CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE (CNRS)、LE RESEAU INTERNATIONAL DES INSTITUTS PASTEUR (RIIP)、UNIVERSITY OF LONDON、UNITED STATES DEPARTMENT OF ENERGY (DOE)、MASSACHUSETTS INSTITUTE OF TECHNOLOGY (MIT)等高校与科研机构是期刊的主要发文单位。